关于偏头痛的一种理论是，它是由血清素水平下降引发的。一种药物，sumatriptan，通过提高血清素作为再摄取抑制剂的作用。既然色氨酸会转化为血清素，那么色氨酸补充剂是否可以帮助对抗偏头痛呢？有没有这方面的研究呢？
苏木曲坦能激活血管5-HT1受体。这导致了血管收缩，这就是被认为是帮助偏头痛的原因。这是同样的想法，给咖啡因，这也是一种血管收缩剂。由于各种原因，服用色氨酸很可能会对终止偏头痛没有效果。首先，它将不得不被摄入和吸收，这需要时间，然后它将不得不被代谢为5-HT 血清素）。) 即使色氨酸在胃中被吸收，也不能及时终止偏头痛，因此患者的耐受性不好。
其次，几乎没有证据表明口服色氨酸补充剂会增加5-羟色胺水平Cynober等(2016))。此外，在任何剂量的色氨酸补充下，受试者的情绪没有明显变化。这表明色氨酸没有被代谢成5-羟色胺。这是有道理的，因为色氨酸是在我们的饮食中，并且认为我们的身体没有调节5-HT代谢（也就是说，我们的身体只是在每次吃了含有色氨酸的东西后，就会自动产生5-HT），这是很疯狂的。因此，色氨酸很可能不是一个解决方案。
Cynober, L., Bier, D. M., Kadowaki, M., Morris Jr, S. M., Elango, R., & Smriga, M.（2016）. Proposals for Upper Limits of Safe Intake for Arginine and Tryptophan in Young Adults and an Upper Limit of Safe Intake for Leucine in the Elderly-3. The Journal of nutrition, 146(12), 2652S-2654S.